Fonctions : Responsable du pôle de bio-informatique Catégorie : A Corps : IGR BAP : A CDD de 1 an, renouvelable. A pourvoir dès que possible. Mission : Le/La responsable du pôle de bio-informatique de l'unité assure le développement et l'automatisation des workflows d'analyse de données omiques, la structuration des bases de données et des systèmes d'information, ainsi que l'implémentation et le développement des programmes informatiques associés aux plateformes automatisées de l'unité. Activités principales : Concevoir des workflows automatisés pour l'analyse de données ou le pilotage d'instruments Concevoir et élaborer la structure de bases de données et de systèmes d'information permettant de collecter, structurer, stocker et mettre en relation les données Guider le déploiement de l'infrastructure informatique des plateformes de la BFASU Définir le plan d'étude et de recueil des données le mieux adapté au problème posé Analyser des données de génomique (séquençage), protéomique et métabolomique (MS) Diffuser et valoriser les résultats sous forme de rapports techniques, de publications ou de présentations orales auprès des communautés professionnelles et scientifiques Gérer l'ensemble des moyens techniques alloués aux dispositifs de collecte et de traitement de données Former, en interne et en externe, aux principes et à la mise en oeuvre des techniques de l'analyse des données biologiques Orienter et conseiller les utilisateurs pour la mise en oeuvre des méthodes d'études et d'interprétation des résultats Conduite de projets : Oui Encadrement : Non Connaissances transversales requises : Connaissance théorique des différents types de protocoles expérimentaux biologiques Connaissance approfondie des méthodes de recueil, d'analyse et de traitement des données Connaissance solide en informatique : maîtrise des systèmes UNIX/LINUX, clusters de calculs, maîtrise d'un ou plusieurs langages de programmation, dont obligatoirement Python (Bash, C++, R, JavaScript, HTML, PHP, Java, PERL), maîtrise de la gestion des bases de données SQL et interfaces web (Apache, Django). Maîtrise de logiciels de gestion de version (Git, GitLab Maîtrise des problématiques liées aux Big Data Connaissance générale des approche d'IA/ML appliquées à l'ingénierie du vivant Langue anglaise : B2 à C1 (cadre européen commun de référence pour les langues) Savoir-faire : Maîtrise des techniques principales d'analyse statistique de données scientifiques (paramétrique/non-paramétrique/bayésien) Savoir développer des outils de traitements automatisés de données biologiques pour les appliquer à des technologies de recherche en biologie Rédiger des documents scientifiques et assurer une gestion des projets scientifiques Développer une expertise scientifique et technologique Encadrer des étudiant-es Gérer la confidentialité des projets (NDA, propriété intellectuelle, secret des affaires) Savoir-être : Aptitude à s'inscrire dans des projets collectifs et goût du travail en équipe Capacité d'innovation et de créativité, d'initiative et autonomie dans le travail Rigueur, organisation, méthode Diplôme réglementaire souhaité : Doctorat Domaine de formation souhaité : bioinformatique Choisir Sorbonne Université, c'est rejoindre une université engagée sur les enjeux de développement durable, de diversité, d'égalité, d'innovation, de diffusion des savoirs, d'ouverture sur le monde et de qualité de vie au travail de ses personnels. Université pluridisciplinaire de recherche intensive de rang mondial, elle s'attache à répondre aux enjeux scientifiques du 21e siècle et à transmettre les connaissances issues de ses laboratoires et de ses équipes de recherche. Déployant ses formations auprès de 55 000 étudiantes et étudiants dont 4000 doctorantes et doctorants et 12300 étudiantes et étudiants étrangers, elle regroupe plus de 3300 enseignantes et enseignants, enseignantes-chercheuses et enseignants-chercheurs, chercheuses et chercheurs, près de 4 000 enseignants-chercheurs et enseignants partenaires, environ 3 000 personnels de bibliothèque, administratifs, technique, sociaux et de santé (BIATSS) et 2000 IATSS partenaires. Son budget est de plus de 700 M€. Située au coeur de Paris, elle présente une organisation avec des directions inter-facultaires et trois facultés de « Lettres », « Santé » et « Sciences et Ingénierie » et est présente dans plus de 27 sites en Ile-de-France et en régions.
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