Utilisation de méthodes et d'outils d'intelligence artificielle (IA) qui a eu un impact considérable sur le domaine de la protéomique (Neely et al., 2023 - https://doi.org/10.1021/acs.jproteome.2c00711).
Le doctorant (H/F) sera rattaché à l'École Doctorale des Sciences Chimiques de l'Université de Strasbourg (ED222).
L'objectif de ce projet de thèse est de développer de nouvelles approches pour interpréter des données de protéomique à grande échelle en utilisant des modèles basés sur l'IA, afin d'en extraire des informations biologiques nouvelles et pertinentes. Une attention particulière sera portée à l'intégration des modifications post-traductionnelles des protéines dans ces modèles basés sur l'IA, dans le but d'élucider leurs rôles spécifiques et leurs contributions à la (dys)fonction des cellules et des tissus au niveau moléculaire.
Contexte de travail
L'Institut Pluridisciplinaire Hubert CURIEN (IPHC), unité mixte de recherche sous cotutelle du CNRS et de l'Université de Strasbourg (UMR7178), est un laboratoire pluridisciplinaire où des équipes de recherche de cultures scientifiques différentes (écologie, physiologie et éthologie, chimie et physique subatomique) développent des programmes de très haut niveau avec pour socle l'instrumentation scientifique. L'IPHC est structuré en 3 départements et comptabilise un effectif total de 393 agents (H/F) dont 257 agents permanents (soit 119 chercheurs et enseignants-chercheurs et 138 ingénieurs et techniciens H/F), 46 agents en CDD et 102 doctorants H/F.
Le candidat (H/F) intègrera l'équipe "Laboratoire de Spectrométrie de Masse Bio-Organique" (LSMBO) de l'IPHC composée de 9 chercheurs et enseignants-chercheurs (H/F), de 11 ingénieurs (H/F), de post-doctorants et de doctorants et
bénéficiera de toutes les conditions matérielles (instruments de LC-MS/MS), du soutien humain (partage d'expertise), ainsi que des ressources (bio-)informatiques (accès à des équipements de calcul puissants et à des logiciels pour le traitement et le retraitement des données LC-MS/MS) nécessaires à la réussite de ce projet de thèse.
Le candidat (H/F) doit être titulaire d'un diplôme de master et/ou d'ingénieur.
Il ou elle devra démontrer une solide connaissance de l'analyse de données (bio-)informatiques ainsi que des langages de programmation (notamment Python), et devra avoir une expérience préalable de l'application de méthodes d'apprentissage automatique ou d'intelligence artificielle. Un fort intérêt pour la biologie et/ou la biochimie constituera un atout.
Le doctorant (H/F) doit avoir une bonne maîtrise de l'anglais, à l'écrit comme à l'oral (de niveau B2 selon le cadre européen commun de référence pour les langues) afin de pouvoir rendre compte régulièrement de ses travaux et présenter ses résultats aux collaborateurs ainsi qu'au cours de conférences
Les candidatures devront inclure un CV détaillé, une lettre de motivation, un résumé du mémoire de master ainsi que les notes de Master 1 et 2.
Le candidat (H/F) bénéficiera de l'accès à un restaurant administratif, d'une prise en charge partielle des titres de transport, d'un comité d'entreprise, la possibilité de télétravail pour une partie des activités et de formations pour l'adaptation au poste de travail.
Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.
Contraintes et risques
- Travail occasionnel en horaire décalé.
- Travail dans un environnement certifié ISO 9001
En cliquant sur "JE DÉPOSE MON CV", vous acceptez nos CGU et déclarez avoir pris connaissance de la politique de protection des données du site jobijoba.com.