Doctorant h/f: machine learning pour le volatilome dans le diagnostic d'infections respiratoires

Doctorant H/F: Machine Learning pour le volatilome dans le diagnostic d'infections respiratoires, Lyon

Informations générales

Intitulé de l'offre : Doctorant H/F: Machine Learning pour le volatilome dans le diagnostic d'infections respiratoires
Référence : UMR5672-PIEBOR-001
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : LYON 07
Date de publication : lundi 16 juin 2025
Type de contrat : CDD Doctorant
Durée du contrat : 36 mois
Date de début de la thèse : 1 septembre 2025
Quotité de travail : Complet
Rémunération : 2200,00 € mensuel
Section(s) CN : 07 - Sciences de l'information : traitements, systèmes intégrés matériel-logiciel, robots, commandes, images, contenus, interactions, signaux et langues

Description du sujet de thèse

Ce projet de thèse vise à développer des méthodes d'apprentissage machine pour analyser le volatilome (air expiré mesuré par spectrométrie de masse) afin de diagnostiquer des infections respiratoires. L'objectif est de créer des profils et marqueurs robustes, explicables, pour caractériser les pathogènes ou la réponse immunitaire, même dans des conditions variées de mesure, et de détecter des pathogènes émergents. Le travail inclut la conception de techniques adaptées aux données limitées, l'extraction d'éléments pertinents, et la détection de groupes émergents ou anormaux, tout en évaluant la confiance dans les classifications. La méthodologie combinera théorie et pratique, appliquée aux données du projet VORTEX.

Contexte de travail

Le ou la candidate intégrera l'équipe Sisyphe du Laboratoire de Physique à l'ENS Lyon, en collaboration avec le LBBE et le projet VORTEX du PEPR MIE. L'environnement offre l'accès à des experts en traitement du signal, apprentissage automatique, analyse de données biologiques et médicales. L'équipe se spécialise dans le traitement de données complexes, hétérogènes, non stationnaires, et dans diverses applications telles que la santé, la neurosciences, la génomique, et les maladies infectieuses. Le poste est soumis à l'autorisation du MESR conformément à la réglementation en vigueur.

#J-18808-Ljbffr