Ingénieur d'etudes en bioinformatique

Vos missions en quelques mots Mission principale : Le but du projet est de comprendre les interactions entre génétique et environnement dans le développement du cancer du foie, en particulier dans le cadre de l’exposition à l’alcool, en effectuant des analyses multi-omiques et multi-échelles d’une importante cohorte de carcinomes hépatocellulaires. Des données de whole genome sequencing, RNAseq, RRBS, single cell, transcriptomiques spatiale seront générées au laboratoire et analysée dans le cadre de ce projet. Activités principales : • Développer des outils bioinformatiques et d’analyse de données innovant visant à l’intégration des données génomiques, biologiques et cliniques • Développer le projet de recherche et les nouveaux outils nécessaires à la compréhension de l’hétérogénéité tumorale et son lien avec la réponse au traitement • Collaborer avec les biologistes et bioinformaticiens de l’équipe • Participer aux réunions de laboratoire hebdomadaire, diffuser et valoriser les résultats sous forme de rapports, présentations orales, rédaction des articles Profil recherché Connaissances : • Avoir des compétences en statistiques et génomique, maitrise des langages de programmation R, Perl, Python, (java et sql serait un plus) • Traitement et analyse des données de génomiques à grande échelle : whole-exome, RNAseq/single-cell RNAseq, methylome • Anglais écrit et parlé Savoir-faire : • Savoir interagir avec des personnes ayant des horizons et intérêts variés (biologie, bioinformatique, etc.). • Etre autonome pour développer un projet de recherche et savoir travailler en équipe Aptitudes : • Assurer une veille scientifique et technologique dans son domaine de compétence Expérience(s) souhaité(s) : • Débutants acceptés Niveau de diplôme et formation(s) • Master en biologie ou bioinformatique Niveau d'études minimum requis Niveau Niveau 7 Master/diplômes équivalents