Doctorat (h/f) – 36 mois – génomique/microbiologie (alimentation)

Informations générales Organisme de rattachement CNRS Référence UMR5300-NICBRU-003 Date de début de diffusion 05/11/2025 Date de parution 25/11/2025 Date de fin de diffusion 26/11/2025 Versant Fonction Publique de l'Etat Catégorie Catégorie A (cadre) Nature de l'emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels Domaine / Métier Recherche - Chercheuse / Chercheur Statut du poste Vacant Intitulé du poste Doctorat (H/F) – 36 mois – génomique/microbiologie (alimentation) Descriptif de l'employeur Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique. Description du poste Sujet de thèse : Ce projet de thèse s’inscrit dans le programme PAPALIM - Biological and societal impacts of the food transition in Papua New Guinea Le cadre du projet PAPALIM Notre alimentation est à l'interface entre notre biologie et notre société. Cet équilibre, hérité de milliers d'années de coévolution, est aujourd'hui en pleine transition, sous l'effet du changement climatique et de l'industrialisation. Ce phénomène est particulièrement marqué dans les pays du Sud, impactant la santé et la structure sociale de ces populations. À ce titre, la Papouasie-Nouvelle-Guinée (PNG) constitue un cas exceptionnel, étant dans l'histoire de l'humanité l'un des rares berceaux de l'agriculture, s'appuyant sur une biodiversité unique au monde et ayant nourri pendant des millénaires une population d'une incomparable diversité culturelle et biologique. Mais aujourd'hui, la PNG, l'un des pays les plus pauvres du monde, connaît une forte acculturation et une augmentation des maladies liées à la malnutrition. Le projet PAPALIM adopte une approche résolument « inter-sciences », combinant les expertises complémentaires en génétique humaine et en microbiologie du CRBE (UT3), avec celles en anthropologie et sociologie nutritionnelles du CERTOP (UT2). Ses objectifs sont : (i) explorer les interactions biologiques et sociétales entre les populations de Papouasie-Nouvelle-Guinée et leur alimentation traditionnelle ; (ii) caractériser l’impact de la transition alimentaire sur la santé et la socialisation des populations ; (iii) proposer une synthèse bioculturelle des relations entre les populations et leur alimentation, éclairant ainsi les politiques de santé publique du pays. Le projet PAPALIM s’inscrit au cœur des trois piliers thématiques de TIRIS, avec l’ambition de fédérer des axes forts présents sur le site toulousain, dans le cadre de deux thèses de doctorat, afin de faire émerger un nouveau réseau de compétences scientifiques pluridisciplinaires sur les régimes alimentaires des pays du Sud. PAPALIM propose deux allocations doctorales qui seront conduites en parallèle. Le présent projet étudiera les mécanismes biologiques des interactions entre le génome humain, le microbiome et le régime alimentaire, en utilisant la biodiversité exceptionnelle de la Papouasie-Nouvelle-Guinée (PNG) comme cas d’étude. La PNG abrite l'une des plus riches diversités florales du monde, utilisée comme principale ressource alimentaire par les populations depuis 50 000 ans. Comment l'alimentation a-t-elle façonné le microbiome et le génome humain en PNG ? Dans quelle mesure le passage récent à une alimentation urbaine peut-il entraîner des maladaptations ? Le/la doctorant/e étudiera les génomes, les microbiomes et les régimes alimentaires de 300 individus ruraux de PNG de deux régions différentes (hautes terres/basses terres) et de 50 individus urbains de PNG. Le/la doctorant/e définira des variants génétiques et des taxons microb Voir plus sur le site emploi.cnrs.fr Conditions particulières d'exercice Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche. Descriptif du profil recherché Contraintes et risques : Le poste est basé à Toulouse et le contrat est d’une durée de 3 ans. Permis B obligatoire. Des déplacements sont prévus dans le cadre de la recherche en Papouasie Nouvelle Guinée et en Malaisie. En cas d'impossibilité de mener des travaux de terrain en Papouasie-Nouvelle-Guinée (instabilité politique, Covid-19), les données anthropologiques et biologiques seront collectées par nos collaborateurs locaux. Afin que les deux projets de thèse puissent démarrer dans les meilleures conditions possibles, des données biologiques préliminaires (n = 100 génomes et microbiomes oraux) et anthropologiques (n = 100 questionnaires) sont d'ores et déjà disponibles. L'expérience de terrain en Papouasie-Nouvelle-Guinée des responsables CRBE du projet, l'expertise et la complémentarité de l'équipe (CRBE-CERTOP-CAM-UPNG), ainsi que les données déjà disponibles, garantiront le succès du projet. Temps plein Oui Rémunération contractuels (en € brut/an) La rémunération est d'un minimum de 2200,00 € mensuel Localisation du poste Europe, France, Occitanie, Haute Garonne (31) Géolocalisation du poste TOULOUSE Lieu d'affectation (sans géolocalisation) 31062 TOULOUSE (France) Critères candidat Niveau d'études / Diplôme Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents Spécialisation Formations générales Langues Français (Seuil)