L'ingénieur (H/F) aura pour mission la mise en œuvre des différents outils bioinformatiques nécessaires à l’estimation des taux de mutation des microalgues du phytoplancton. Il/elle mettra également en œuvre les outils de biologie moléculaire nécessaires à la caractérisation des signatures épigénomiques des microalgues. Enfin, il/elle devra réaliser des cultures de picophytoplancton en utilisant la cytométrie en flux dans le cadre de la réalisation d’expériences d’accumulation de mutations
Activités
- Analyses de génomes, transcriptomes
- Analyse des patrons de méthylation
- Cultures de microalgues et expériences d’accumulation de mutations
Compétences
- Connaissances solides en bioinformatique (analyses NGS, assemblage, annotation, programmation R, méthodes de génomique comparative)
- Expertise en biologie moléculaire (extraction d’ADN, ARN)
- Expertise en expériences d’accumulation de mutations en milieu liquide
- Expertise en cytométrie en flux
- Maîtrise de l'anglais scientifique et technique
- Autonomie, rigueur, et ouverture d’esprit
- Capacité de communication
Contexte de travail
Le poste sera affecté à l’UMR8176, Biodiversité et Biotechnologie Marine (LBBM), qui fait partie de l’observatoire océanologique de Banyuls sur mer. L’unité LBBM compte une trentaine de personnes qui s’intéressent à des questions biologiques variées, dont la génomique évolutive et environnementale du phytoplancton et des virus associés.
La personne recrutée participera activement aux projets développés dans le cadre des bases moléculaires de la diversification des microalgues du phytoplancton au sein de l’axe GENOPHY.
Le poste sera affecté à l’UMR8176, Biodiversité et Biotechnologie Marine (LBBM), qui fait partie de l’observatoire océanologique de Banyuls sur mer. L’unité LBBM compte une trentaine de personnes qui s’intéressent à des questions biologiques variées, dont la génomique évolutive et environnementale du phytoplancton et des virus associés.
La personne recrutée participera activement aux projets développés dans le cadre des bases moléculaires de la diversification des microalgues du phytoplancton au sein de l’axe GENOPHY.
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